磁力搅拌器结构主要由减速机、连接体、磁力传动器、轴承体、密封桶、滑动轴承、搅拌轴、桨叶等部件组成。其中，磁力传动器由内、外磁转子及隔离套三部分组成。

 在磁力搅拌机中，桨叶、搅拌轴与内磁转子连为一体，通过轴承支撑组成工作件，为设备从动件;外磁转子与减速机连为一体组成动力件，为设备主动件; 从动件和主动件被隔离套完全隔离。

工作时，由电机经减速机带动外磁转子转动，由于内、外磁转子间存在磁场，外磁转子会通过磁力耦合作用于内磁转子，从而驱动与内磁转子连接的工作件 ( 即搅拌轴等) 进行同步旋转，实现无接触传递扭矩的目的。